Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD33

Sgtb, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgtbQ8VD33 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgtbQ8VD33 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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