Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Rdh10Q8VCH7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Rdh10Q8VCH7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Rdh10Q8VCH7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rdh10Q8VCH7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rdh10Q8VCH7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rdh10Q8VCH7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rdh10Q8VCH7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rdh10Q8VCH7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rdh10Q8VCH7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rdh10Q8VCH7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rdh10Q8VCH7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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