Protein–RNA interactions for Protein: Q8R574

Prpsap2, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap2Q8R574 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpsap2Q8R574 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpsap2Q8R574 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpsap2Q8R574 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms