Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc12Q8R344 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms