Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b4Q8QZY9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b4Q8QZY9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms