Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf183Q8QZS5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf183Q8QZS5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms