Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z2

Fndc5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc5Q8K4Z2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc5Q8K4Z2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fndc5Q8K4Z2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms