Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Hecw1Q8K4P8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms