Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssh3Q8K330 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ssh3Q8K330 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms