Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nsl1Q8K305 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nsl1Q8K305 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms