Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Stn1Q8K2X3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stn1Q8K2X3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms