Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrrdQ8K2M3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms