Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc12Q8K2L8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms