Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brd3Q8K2F0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brd3Q8K2F0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms