Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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