Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Polr1eQ8K202 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1eQ8K202 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms