Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prkd3Q8K1Y2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prkd3Q8K1Y2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms