Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpne5Q8JZW4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cpne5Q8JZW4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms