Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CopaQ8CIE6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CopaQ8CIE6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms