Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp27Q8CEG8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp27Q8CEG8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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