Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE47

Slc49a3, Solute carrier family 49 member A3, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc49a3Q8CE47 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc49a3Q8CE47 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc49a3Q8CE47 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc49a3Q8CE47 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc49a3Q8CE47 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc49a3Q8CE47 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc49a3Q8CE47 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc49a3Q8CE47 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc49a3Q8CE47 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc49a3Q8CE47 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc49a3Q8CE47 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc49a3Q8CE47 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc49a3Q8CE47 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc49a3Q8CE47 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc49a3Q8CE47 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc49a3Q8CE47 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc49a3Q8CE47 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc49a3Q8CE47 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms