Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDS7

Uncharacterized protein C21orf140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CDS7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CDS7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CDS7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CDS7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CDS7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CDS7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CDS7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CDS7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CDS7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CDS7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CDS7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CDS7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CDS7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CDS7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CDS7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CDS7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CDS7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CDS7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CDS7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CDS7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CDS7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms