Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nrip1Q8CBD1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrip1Q8CBD1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms