Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
A430089I19RikQ8C9W1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A430089I19RikQ8C9W1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms