Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc159Q8C963 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms