Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ctdsp2Q8BX07 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ctdsp2Q8BX07 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ctdsp2Q8BX07 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ctdsp2Q8BX07 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ctdsp2Q8BX07 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ctdsp2Q8BX07 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ctdsp2Q8BX07 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ctdsp2Q8BX07 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ctdsp2Q8BX07 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctdsp2Q8BX07 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ctdsp2Q8BX07 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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