Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW22

Ss18l1, Calcium-responsive transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l1Q8BW22 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18l1Q8BW22 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms