Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssc5dQ8BV57 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssc5dQ8BV57 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.28■■□□□ 1
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