Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRU4

Clec9a, C-type lectin domain family 9 member A, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec9aQ8BRU4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec9aQ8BRU4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec9aQ8BRU4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec9aQ8BRU4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec9aQ8BRU4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec9aQ8BRU4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec9aQ8BRU4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec9aQ8BRU4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec9aQ8BRU4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec9aQ8BRU4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec9aQ8BRU4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec9aQ8BRU4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec9aQ8BRU4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec9aQ8BRU4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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