Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hirip3Q8BLH7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hirip3Q8BLH7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms