Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp54Q8BL06 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp54Q8BL06 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms