Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnrc6bQ8BKI2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms