Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Usp1Q8BJQ2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp1Q8BJQ2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp1Q8BJQ2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp1Q8BJQ2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp1Q8BJQ2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp1Q8BJQ2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp1Q8BJQ2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp1Q8BJQ2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp1Q8BJQ2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp1Q8BJQ2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp1Q8BJQ2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp1Q8BJQ2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp1Q8BJQ2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp1Q8BJQ2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp1Q8BJQ2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Usp1Q8BJQ2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp1Q8BJQ2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Usp1Q8BJQ2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp1Q8BJQ2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp1Q8BJQ2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp1Q8BJQ2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp1Q8BJQ2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Usp1Q8BJQ2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp1Q8BJQ2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Usp1Q8BJQ2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Usp1Q8BJQ2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp1Q8BJQ2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Usp1Q8BJQ2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Usp1Q8BJQ2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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