Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
U2af1l4Q8BGJ9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U2af1l4Q8BGJ9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U2af1l4Q8BGJ9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U2af1l4Q8BGJ9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U2af1l4Q8BGJ9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U2af1l4Q8BGJ9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U2af1l4Q8BGJ9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U2af1l4Q8BGJ9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
U2af1l4Q8BGJ9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U2af1l4Q8BGJ9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
U2af1l4Q8BGJ9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
U2af1l4Q8BGJ9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
U2af1l4Q8BGJ9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
U2af1l4Q8BGJ9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U2af1l4Q8BGJ9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
U2af1l4Q8BGJ9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
U2af1l4Q8BGJ9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
U2af1l4Q8BGJ9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
U2af1l4Q8BGJ9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
U2af1l4Q8BGJ9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
U2af1l4Q8BGJ9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
U2af1l4Q8BGJ9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
U2af1l4Q8BGJ9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
U2af1l4Q8BGJ9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
U2af1l4Q8BGJ9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
U2af1l4Q8BGJ9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
U2af1l4Q8BGJ9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms