Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChfrQ810L3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms