Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Amigo1Q80ZD8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
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Amigo1Q80ZD8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Amigo1Q80ZD8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Amigo1Q80ZD8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Amigo1Q80ZD8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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