Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pja2Q80U04 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms