Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cul9Q80TT8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cul9Q80TT8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cul9Q80TT8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cul9Q80TT8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cul9Q80TT8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul9Q80TT8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms