Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NischQ80TM9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
NischQ80TM9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
NischQ80TM9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
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