Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf8Q80TJ7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf8Q80TJ7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf8Q80TJ7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf8Q80TJ7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf8Q80TJ7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Phf8Q80TJ7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf8Q80TJ7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf8Q80TJ7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf8Q80TJ7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf8Q80TJ7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf8Q80TJ7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf8Q80TJ7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf8Q80TJ7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf8Q80TJ7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf8Q80TJ7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf8Q80TJ7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf8Q80TJ7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms