Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cdc42bpbQ7TT50 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdc42bpbQ7TT50 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdc42bpbQ7TT50 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdc42bpbQ7TT50 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdc42bpbQ7TT50 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdc42bpbQ7TT50 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms