Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ckap2lQ7TS74 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms