Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim17Q7TPM3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms