Protein–RNA interactions for Protein: Q7TM95

Tigd3, Tigger transposable element-derived protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd3Q7TM95 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tigd3Q7TM95 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tigd3Q7TM95 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms