Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TwistnbQ78WZ7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TwistnbQ78WZ7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms