Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SynmQ70IV5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SynmQ70IV5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SynmQ70IV5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms