Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RfflQ6ZQM0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms