Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ncapd3Q6ZQK0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms