Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

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Length 800 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chsy1Q6ZQ11 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms