Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn5Q6VZZ7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms